Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM12Q9H4Q4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM12Q9H4Q4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM12Q9H4Q4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms