Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
SENP3Q9H4L4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SENP3Q9H4L4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SENP3Q9H4L4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SENP3Q9H4L4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms