Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSTN2Q9H4D0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSTN2Q9H4D0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSTN2Q9H4D0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSTN2Q9H4D0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSTN2Q9H4D0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSTN2Q9H4D0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSTN2Q9H4D0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms