Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF39Q9H2S5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF39Q9H2S5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF39Q9H2S5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF39Q9H2S5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms