Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX5Q9H2C1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX5Q9H2C1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX5Q9H2C1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX5Q9H2C1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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