Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED28Q9H204 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED28Q9H204 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED28Q9H204 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED28Q9H204 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED28Q9H204 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED28Q9H204 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED28Q9H204 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED28Q9H204 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED28Q9H204 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED28Q9H204 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED28Q9H204 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED28Q9H204 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED28Q9H204 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED28Q9H204 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED28Q9H204 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED28Q9H204 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED28Q9H204 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED28Q9H204 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED28Q9H204 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED28Q9H204 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED28Q9H204 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED28Q9H204 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED28Q9H204 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED28Q9H204 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED28Q9H204 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MED28Q9H204 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED28Q9H204 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED28Q9H204 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED28Q9H204 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED28Q9H204 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED28Q9H204 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED28Q9H204 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED28Q9H204 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED28Q9H204 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED28Q9H204 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED28Q9H204 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms