Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV7

HAPLN2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN2Q9GZV7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HAPLN2Q9GZV7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HAPLN2Q9GZV7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HAPLN2Q9GZV7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HAPLN2Q9GZV7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HAPLN2Q9GZV7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HAPLN2Q9GZV7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.51■■■□□ 2
HAPLN2Q9GZV7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HAPLN2Q9GZV7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HAPLN2Q9GZV7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HAPLN2Q9GZV7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms