Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTDSP1Q9GZU7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms