Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2J2Q9GZM3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2J2Q9GZM3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2J2Q9GZM3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms