Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM6Q9C030 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM6Q9C030 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM6Q9C030 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms