Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRIM7Q9C029 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM7Q9C029 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM7Q9C029 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM7Q9C029 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms