Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
BRIP1Q9BX63 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
BRIP1Q9BX63 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
BRIP1Q9BX63 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms