Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTDSS2Q9BVG9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS2Q9BVG9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS2Q9BVG9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS2Q9BVG9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTDSS2Q9BVG9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTDSS2Q9BVG9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTDSS2Q9BVG9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTDSS2Q9BVG9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTDSS2Q9BVG9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS2Q9BVG9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms