Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM175Q9BSA9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM175Q9BSA9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM175Q9BSA9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms