Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPKQ9BS16 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPKQ9BS16 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPKQ9BS16 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms