Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI9

NRIP2, Nuclear receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP2Q9BQI9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP2Q9BQI9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP2Q9BQI9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP2Q9BQI9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms