Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRTNQ99748 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRTNQ99748 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NRTNQ99748 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRTNQ99748 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms