Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC38A3Q99624 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A3Q99624 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A3Q99624 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A3Q99624 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms