Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP4Q99569 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKP4Q99569 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP4Q99569 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP4Q99569 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKP4Q99569 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKP4Q99569 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP4Q99569 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP4Q99569 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP4Q99569 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP4Q99569 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP4Q99569 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms