Protein–RNA interactions for Protein: Q99222

AFI1, ARF3-interacting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFI1Q99222 SDH8YBR269C 417 nt7.48□□□□□ -1.21
AFI1Q99222 VPS65YLR322W 315 nt7.47□□□□□ -1.21
AFI1Q99222 ADH6YMR318C 1083 nt7.47□□□□□ -1.21
AFI1Q99222 HOG1YLR113W 1308 nt7.47□□□□□ -1.21
AFI1Q99222 CDC3YLR314C 1563 nt7.46□□□□□ -1.21
AFI1Q99222 PUP2YGR253C 783 nt7.46□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 PDC5YLR134W 1692 nt7.46□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 BDS1YOL164W 1941 nt7.46□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 MAS2YHR024C 1449 nt7.45□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 OPI1YHL020C 1215 nt7.45□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 PRY2YKR013W 990 nt7.45□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 RCF2YNR018W 675 nt7.45□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 MDH2YOL126C 1134 nt7.45□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 YPL247CYPL247C 1572 nt7.45□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 SKP1YDR328C 585 nt7.44□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 CKI1YLR133W 1749 nt7.44□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 GCD11YER025W 1584 nt7.43□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 PMT7YDR307W 1989 nt7.43□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 PIL1YGR086C 1020 nt7.43□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 CAR2YLR438W 1275 nt7.43□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 RSC9YML127W 1746 nt7.42□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 LEO1YOR123C 1395 nt7.42□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 ECM27YJR106W 2178 nt7.42□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 RUP1YOR138C 2016 nt7.41□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 SLM3YDL033C 1254 nt7.41□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 UME1YPL139C 1383 nt7.41□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 YBL111CYBL111C 2004 nt7.4□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.4□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 SNF7YLR025W 723 nt7.4□□□□□ -1.22
AFI1Q99222 ADE2YOR128C 1716 nt7.4□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 SGF73YGL066W 1974 nt7.39□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 SNA3YJL151C 402 nt7.39□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 PTH2YBL057C 627 nt7.39□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YJL045WYJL045W 1905 nt7.39□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.38□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 PFS2YNL317W 1398 nt7.37□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YPQ1YOL092W 927 nt7.37□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YPL067CYPL067C 597 nt7.37□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 LAS17YOR181W 1902 nt7.37□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 LAT1YNL071W 1449 nt7.36□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.36□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.36□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.36□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.36□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 CYS3YAL012W 1185 nt7.35□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YJL213WYJL213W 996 nt7.35□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YML122CYML122C 381 nt7.35□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 MBF1YOR298C-A 456 nt7.35□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YPL041CYPL041C 624 nt7.35□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 ECM10YEL030W 1935 nt7.35□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 HSV2YGR223C 1347 nt7.34□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 CCW12YLR110C 402 nt7.34□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YAH1YPL252C 519 nt7.34□□□□□ -1.23
AFI1Q99222 YBL113CYBL113C 2379 nt7.33□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 COS10YNR075W 1125 nt7.33□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 HNM1YGL077C 1692 nt7.32□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 PAM17YKR065C 594 nt7.32□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 YOX1YML027W 1158 nt7.32□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 CST26YBR042C 1194 nt7.32□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 RTC2YBR147W 891 nt7.32□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 TPI1YDR050C 747 nt7.31□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 TRR2YHR106W 1029 nt7.31□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 TCB1YOR086C 3561 nt7.3□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 PRS4YBL068W 981 nt7.3□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 YEL023CYEL023C 2049 nt7.3□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 AFG3YER017C 2286 nt7.3□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 ERG24YNL280C 1317 nt7.29□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 AIM34YMR003W 597 nt7.29□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 GGC1YDL198C 903 nt7.28□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 FRT1YOR324C 1809 nt7.28□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 CIT2YCR005C 1383 nt7.28□□□□□ -1.24
AFI1Q99222 UBP13YBL067C 2244 nt7.27□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 DML1YMR211W 1428 nt7.27□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 YDR327WYDR327W 327 nt7.26□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 YPQ2YDR352W 954 nt7.26□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 DCR2YLR361C 1737 nt7.26□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 MAM3YOL060C 2121 nt7.25□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 NFS1YCL017C 1494 nt7.25□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 PDA1YER178W 1263 nt7.25□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 YGL260WYGL260W 231 nt7.25□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 URA1YKL216W 945 nt7.25□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 AIM46YHR199C 933 nt7.24□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 RTC4YNL254C 1206 nt7.24□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 NAF1YNL124W 1479 nt7.24□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 PET117YER058W 324 nt7.23□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 GNA1YFL017C 480 nt7.23□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 ATP10YLR393W 840 nt7.23□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 snR30snR30 606 nt7.23□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 YKR023WYKR023W 1593 nt7.23□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 CTF3YLR381W 2202 nt7.22□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 ZIM17YNL310C 525 nt7.22□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 ITR1YDR497C 1755 nt7.22□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 RDR1YOR380W 1641 nt7.22□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 HDA1YNL021W 2121 nt7.22□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 YER152CYER152C 1332 nt7.22□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 TUB1YML085C 1344 nt7.22□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 HXT9YJL219W 1704 nt7.21□□□□□ -1.25
AFI1Q99222 TOP3YLR234W 1971 nt7.21□□□□□ -1.26
AFI1Q99222 CHA1YCL064C 1083 nt7.21□□□□□ -1.26
AFI1Q99222 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.2 ms