Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SECISBP2Q96T21 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SECISBP2Q96T21 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SECISBP2Q96T21 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms