Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMF1Q96S06 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMF1Q96S06 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMF1Q96S06 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMF1Q96S06 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMF1Q96S06 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms