Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNC2Q96PR1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNC2Q96PR1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1451.2 ms