Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP3Q96P47 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP3Q96P47 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP3Q96P47 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms