Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC115Q96NT0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC115Q96NT0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC115Q96NT0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms