Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C9orf72Q96LT7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C9orf72Q96LT7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390.5 ms