Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MS4A4AQ96JQ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A4AQ96JQ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MS4A4AQ96JQ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MS4A4AQ96JQ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MS4A4AQ96JQ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MS4A4AQ96JQ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MS4A4AQ96JQ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MS4A4AQ96JQ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MS4A4AQ96JQ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MS4A4AQ96JQ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms