Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPD52L3Q96J77 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPD52L3Q96J77 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52L3Q96J77 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52L3Q96J77 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms