Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCD1Q96GM5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCD1Q96GM5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SMARCD1Q96GM5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms