Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX8

PERP, p53 apoptosis effector related to PMP-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERPQ96FX8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERPQ96FX8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PERPQ96FX8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PERPQ96FX8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PERPQ96FX8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PERPQ96FX8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PERPQ96FX8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PERPQ96FX8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PERPQ96FX8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PERPQ96FX8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PERPQ96FX8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PERPQ96FX8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PERPQ96FX8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PERPQ96FX8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PERPQ96FX8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PERPQ96FX8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PERPQ96FX8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PERPQ96FX8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PERPQ96FX8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms