Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN17Q96FV3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN17Q96FV3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN17Q96FV3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN17Q96FV3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN17Q96FV3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN17Q96FV3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN17Q96FV3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN17Q96FV3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN17Q96FV3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms