Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM44Q96DX7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM44Q96DX7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM44Q96DX7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM44Q96DX7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms