Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC39Q96DD0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC39Q96DD0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC39Q96DD0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms