Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VOPP1Q96AW1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VOPP1Q96AW1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VOPP1Q96AW1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VOPP1Q96AW1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms