Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53INP1Q96A56 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53INP1Q96A56 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53INP1Q96A56 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53INP1Q96A56 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53INP1Q96A56 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53INP1Q96A56 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TP53INP1Q96A56 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53INP1Q96A56 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms