Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2A3Q93084 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP2A3Q93084 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms