Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL2Q92772 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKL2Q92772 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL2Q92772 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms