Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUBCNQ92622 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RUBCNQ92622 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUBCNQ92622 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUBCNQ92622 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms