Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PATJQ8NI35 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PATJQ8NI35 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PATJQ8NI35 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PATJQ8NI35 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PATJQ8NI35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PATJQ8NI35 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PATJQ8NI35 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PATJQ8NI35 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PATJQ8NI35 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PATJQ8NI35 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PATJQ8NI35 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PATJQ8NI35 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms