Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEST2Q8NFU1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEST2Q8NFU1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BEST2Q8NFU1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms