Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEST4Q8NFU0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BEST4Q8NFU0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms