Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF548Q8NEK5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF548Q8NEK5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF548Q8NEK5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF548Q8NEK5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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