Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC74

RBBP8NL, RBBP8 N-terminal-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8NLQ8NC74 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBBP8NLQ8NC74 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBBP8NLQ8NC74 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBBP8NLQ8NC74 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBBP8NLQ8NC74 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RBBP8NLQ8NC74 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBBP8NLQ8NC74 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBBP8NLQ8NC74 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBBP8NLQ8NC74 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms