Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNLDC1Q8NA58 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PNLDC1Q8NA58 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms