Protein–RNA interactions for Protein: Q8N386

LRRC25, Leucine-rich repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25Q8N386 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC25Q8N386 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC25Q8N386 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC25Q8N386 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC25Q8N386 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC25Q8N386 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms