Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR4Q8IZ21 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHACTR4Q8IZ21 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHACTR4Q8IZ21 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHACTR4Q8IZ21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms