Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NELFCDQ8IXH7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELFCDQ8IXH7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NELFCDQ8IXH7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NELFCDQ8IXH7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NELFCDQ8IXH7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms