Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM228AQ86W67 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM228AQ86W67 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM228AQ86W67 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM228AQ86W67 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms