Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAINQ86UA6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAINQ86UA6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPAINQ86UA6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms