Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX20Q7Z614 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX20Q7Z614 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX20Q7Z614 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX20Q7Z614 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX20Q7Z614 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX20Q7Z614 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX20Q7Z614 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX20Q7Z614 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX20Q7Z614 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX20Q7Z614 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX20Q7Z614 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX20Q7Z614 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX20Q7Z614 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms